Onderstaande foto is gemaakt van levende wangslijmcellen. Met een wattenstaafje langs de binnenkant van de wang strijken en het resultaat vervolgens op een objectglaasje brengen. Hierna kunnen de levende cellen behandeld worden met fluorochromen en bekeken worden met een fluorescentie microscoop.

Deze microscoop wordt gebruikt voor preparaten die (al dan niet selectief) gekleurd zijn met een fluorescerende kleurstof.
Om de stof te laten fluoresceren is excitatielicht nodig; uitsluitend dit licht met voor elke kleurstof een specifieke golflengte wordt doorgelaten naar het preparaat. Een fluorescentiemicroscoop heeft hiervoor de geschikte filters.

Vervolgens wordt vanaf het preparaat alleen het fluorescerende (emissie)licht verder doorgestuurd naar het oculair. De kijker ziet dus of niets (donker beeld) of fluorescerende objecten in de zelf gekozen kleur, een erg duidelijk contrastrijk beeld.

Hier te zien zijn groene wangslijmcellen behandeld met Acridine oranje.

In vivo preparaat, 400x, absorptie 460nm, emissie 650nm